首先是化学结构区别：

PFA加入了全氟烷氧基，相当于PTFE中的一个氟原子被全氟烷氧基所取代。某个碳直接连上一个氧，然后氧再连一个全氟甲基或全氟乙基之类的基团。和PTFE相比，降低了熔融粘度有利于加工。其余性质跟PTFE差的不太多的。

其次是应用的区别：

PFA--具有聚四氟乙烯相同的各种优异性能，而且具有良好的热塑性，可用普通热塑性树脂的加工方法进行热塑加工。是四氟乙烯与全氟丙基乙烯基醚以一定比例在含有全氟羧酸盐分散剂，过硫酸盐引发剂的水介质中共聚制得的,观为白色半透明的颗粒。

不仅具有与聚四氟乙烯相同的使用温度，而且在250℃时有更好的机械强度 (约2～3倍)，且耐应力开裂性能优良。其加工范围宽，成型性能好，适合于压塑、挤塑、注塑、传递模塑等成型加工。可制作电线电缆绝缘护套、高频及超高频绝缘零件、化工管道、阀门和泵的耐腐蚀衬里;机械工业用特殊零配件、轻纺工业用各种防腐材料、聚四氟乙烯防腐衬里等焊条。

由可熔性聚四氟乙烯粒料挤出制得,外观为半透明乳白色、表面光滑、截面致密均匀。专用于聚四氟乙烯板、管的焊接，使聚四氟乙烯形状简单的制品，焊接成形状复杂、尺寸较大的制件。

水分散液为四氟乙烯和全氟丙基乙烯基醚共聚反应得到的共聚物加入乳化剂，于一定温度下浓缩后所得。固含量为30%±1%。外观为乳白色或淡黄色半透明。具有可熔性聚四氟乙烯树脂所具有的各种优良性能。能在260℃下长期使用，并以其优异的防黏、防腐、易加工性能开发成先进的涂料，可喷涂、浸渍，被大量地应用于复印技术及食品工业中作为防黏、防腐材料。

PTFE--聚四氟乙烯是由四氟乙烯单体采用悬浮法或分散法聚合而制得。分子量=5.2×105-4.5×107。白色粉末，400目的占75%，无味、无美、无毒。相对密度2.1-2.3，折射率1.37，玻璃化温度327℃，热分解温度415℃。在400℃以上时有微量失重并分解出有毒气体。

使用温度 -250～260 ℃，在210 ℃使用可达10000h。优异的耐化学腐蚀性，耐任何强酸(包括王水)、强碱、油脂，不溶于任何溶剂，摩擦系数极低，耐磨性好，并有自润滑性。耐老化性优良。电性能优异，耐电弧性好。具有不粘性，几乎所有的粘性物质都不能粘附其表面，完全无燃烧性。有“塑料王”之称。拉伸强度(MPa)>23 伸长率(%)>250 。

再次是加工方式的区别：

加工方式最主要的区别是，PFA可以进行热熔注塑加工，而PTFE不能进行热熔注塑加工。来源:塑库网